RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.66□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 GREB1Q4ZG55 1949 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 ERICH2A1L162 156 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 E7EWF7 191 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 TM4SF5O14894 197 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 GLUD1P00367 558 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 ADH1AP07327 375 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 CYP3A4P08684 503 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 RFX1P22670 979 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 GNAQP50148 359 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 DSG1Q02413 1049 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 TRDNQ13061 729 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 DRP2Q13474 957 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 PARM1Q6UWI2 310 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 GLB1LQ6UWU2 654 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 SMC5Q8IY18 1101 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 PGBD1Q96JS3 809 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 MAP7D2Q96T17 732 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 DPP7Q9UHL4 492 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 AKT3Q9Y243 479 aa11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
LAMC1-202ENST00000466964 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 NRP1O14786 923 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SKIP12755 728 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TMOD1P28289 359 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 RAB27AP51159 221 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 DSC1Q08554 894 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 FUT2Q10981 343 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SART3Q15020 963 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 WWC2Q6AWC2 1192 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 NCOA7Q8NI08 942 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 FAM167AQ96KS9 214 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 LNPKQ9C0E8 428 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 USP18Q9UMW8 372 aa11.64□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 FAM170BA6NMN3 283 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TGM5O43548 720 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 STBD1O95210 358 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 PTH1RQ03431 593 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 AP3B2Q13367 1082 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ACAP1Q15027 740 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 COLGALT2Q8IYK4 626 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 MAP4K1Q92918 833 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 LENG9Q96B70 501 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 FNIP2Q9P278 1114 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 CDH7Q9ULB5 785 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 AKAP13Q12802 2813 aa11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ITPR1Q14643 2758 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 LAMA1P25391 3075 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 EDIL3O43854 480 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ZMYND10O75800 440 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 OATP04181 439 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 URODP06132 367 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 RETP07949 1114 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 POU2F2P09086 479 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 LIFRP42702 1097 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 GLUD2P49448 558 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 LIMK1P53667 647 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 SPEM2Q0P670 501 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 CSRP2Q16527 193 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 UBXN11Q5T124 520 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TSSK4Q6SA08 328 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 PLA2G4DQ86XP0 818 aa11.62□□□□□ -0.55
LAMC1-202ENST00000466964 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms