RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 KRT17Q04695 432 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 NFKBIBQ15653 356 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SLFN12Q8IYM2 578 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SUSD6Q92537 303 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 MTMR9Q96QG7 549 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 RIT2Q99578 217 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 KCNMB3Q9NPA1 279 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 LMBRD1Q9NUN5 540 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SPG21Q9NZD8 308 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 LZTS1Q9Y250 596 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 ZNF318Q5VUA4 2279 aa13.85□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 VWA3AA6NCI4 1184 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 IER5LQ5T953 404 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SYCE2Q6PIF2 218 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 PRSS33Q8NF86 280 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 HAS1Q92839 578 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 LPPQ93052 612 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 FAM20AQ96MK3 541 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 KCNH6Q9H252 994 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa13.84□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.19
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WZ62 844 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 A0A0U1RQF3 1178 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP13.83□□□□□ -0.25e-69■□□□□ 8.2
PRAME-208ENST00000438888 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 PSMD10O75832 226 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TXKP42681 527 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 UBE2HP62256 183 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 IL17AQ16552 155 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 PLA2G4FQ68DD2 849 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ADALQ6DHV7 355 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 NLRP4Q96MN2 994 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 CLIC6Q96NY7 704 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 PHOX2BQ99453 314 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 S1PR5Q9H228 398 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 DACT1Q9NYF0 836 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.83□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PQ27 194 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PQ64 194 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PQD8 194 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 C2orf71A6NGG8 1288 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 WEE2P0C1S8 567 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 LONP1P36776 959 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.26e-8■□□□□ 9.8
PRAME-208ENST00000438888 BCAR1P56945 870 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 GRIN1Q05586 938 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 KCNC3Q14003 757 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 PTPN21Q16825 1174 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 XKR3Q5GH77 459 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 KSR1Q8IVT5 923 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 CASP10Q92851 521 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 TMEM169Q96HH4 297 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 RAB34Q9BZG1 259 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 GBP3Q9H0R5 595 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 CSRNP2Q9H175 543 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.82□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 EOMESO95936 686 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 PHKA2P46019 1235 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 DNM2P50570 870 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 VCPP55072 806 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 VPS52Q8N1B4 723 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.81□□□□□ -0.2
PRAME-208ENST00000438888 FBXL6Q8N531 539 aa13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms