RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428343.5

RFX8-201, Transcript of RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RFX8, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8-201ENST00000428343 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TBX20Q9UMR3 447 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.26■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 RHOBTB3O94955 611 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 EDN1P05305 212 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 KCNB1Q14721 858 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SLC17A8Q8NDX2 589 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 IL23AQ9NPF7 189 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SQORQ9Y6N5 450 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ACKR2O00590 384 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 CXCL10P02778 98 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 GTF2BQ00403 316 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 EHHADHQ08426 723 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PSMD2Q13200 908 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 AMHR2Q16671 573 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZNF365Q70YC5 407 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SPATA20Q8TB22 786 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ADAM2Q99965 735 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TCHPQ9BT92 498 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TMX1Q9H3N1 280 aa15.25■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZBBXA8MT70 800 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MGEA5O60502 916 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 FGBP02675 491 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 LIG4P49917 911 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 IKBKEQ14164 716 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZBTB33Q86T24 672 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 VWCEQ96DN2 955 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ACCSQ96QU6 501 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa15.24■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TISP43B9A030 160 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ATF7IP2Q5U623 682 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 RNF169Q8NCN4 708 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 APBB2Q92870 758 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 SCN5AQ14524 2016 aa15.23■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PPP1R37O75864 691 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PFKMP08237 780 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ACTN1P12814 892 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ALCAMQ13740 583 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 FAM187BQ17R55 369 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 NOTUMQ6P988 496 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MAP4K3Q8IVH8 894 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 STRA6Q9BX79 667 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MYH11P35749 1972 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 NPTXRO95502 500 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 BMP6P22004 513 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ABCD1P33897 745 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 MORC3Q14149 939 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 TMEM240Q5SV17 173 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 EEF1DP3Q658K8 133 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.22■□□□□ 0.03
RFX8-201ENST00000428343 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms