RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FZD8Q9H461 694 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 CCL23P55773 120 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ADSSL1Q8N142 457 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 MLKLQ8NB16 471 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM206Q9H813 350 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ACKR2O00590 384 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA0355O15063 1070 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 RAG1P15918 1043 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R2P41236 205 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 LPIN1Q14693 890 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 MBTPS1Q14703 1052 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 FAM187BQ17R55 369 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 FAM228AQ86W67 206 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 SCLYQ96I15 445 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 DACH1Q9UI36 760 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 USP20Q9Y2K6 914 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 LTBP2Q14767 1821 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PSMA7O14818 248 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 EVI5O60447 810 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 EDN1P05305 212 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 HOXD13P35453 343 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PAK2Q13177 524 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 USP38Q8NB14 1042 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 SQORQ9Y6N5 450 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.61■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 B4GALT5O43286 388 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TSPAN1O60635 241 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TIMP1P01033 207 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 CD52P31358 61 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 LIG4P49917 911 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 AMHR2Q16671 573 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 GPR182O15218 404 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 CPB2Q96IY4 423 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 GBP3Q9H0R5 595 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PADI3Q9ULW8 664 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 NBNO60934 754 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PAK1Q13153 545 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 NELFBQ8WX92 580 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXA4-202ENST00000428284 ITGB8P26012 769 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ZPBP2Q6X784 338 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 TISP43B9A030 160 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PIGRP01833 764 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 STX17P56962 302 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 P2RX5Q93086 422 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms