RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ALDH1L1O75891 902 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TOX4O94842 621 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SLPIP03973 132 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 C1SP09871 688 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PTPN21Q16825 1174 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CLEC14AQ86T13 490 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CMIPQ8IY22 773 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 EDAQ92838 391 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FAM89AQ96GI7 184 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SOX7Q9BT81 388 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM8Q9BZR9 551 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CSRNP2Q9H175 543 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 VWA7Q9Y334 891 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 A0A0A6YYJ9 748 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 UBE2QL1A1L167 161 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 GABRDO14764 452 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MAFGO15525 162 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 XPOTO43592 962 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 OPHN1O60890 802 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 STC2O76061 302 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CFBP00751 764 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 LPLP06858 475 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ACRV1P26436 265 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 BCAR1P56945 870 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ERVK-21P61565 698 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KLF10Q13118 480 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FOXE3Q13461 319 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ACAP2Q15057 778 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PDCD1Q15116 288 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 UGT8Q16880 541 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FAM214AQ32MH5 1076 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CT83Q5H943 113 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 KRT40Q6A162 431 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 Q6ZRM9 215 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MB21D1Q8N884 522 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 RABGGTAQ92696 567 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PGBD4Q96DM1 585 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ACAP3Q96P50 834 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MENTQ9BUN1 341 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 NELFAQ9H3P2 528 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PRDM12Q9H4Q4 367 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 IL23AQ9NPF7 189 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MKS1Q9NXB0 559 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ING3Q9NXR8 418 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 USP18Q9UMW8 372 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 EDARQ9UNE0 448 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SHTN1A0MZ66 631 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PRSS38A1L453 326 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 GAAP10253 952 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 GDF5P43026 501 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SCNN1GP51170 649 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 NEK2P51955 445 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CRHR2Q13324 411 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 TOR2AQ5JU69 321 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 PIK3C3Q8NEB9 887 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF503Q96F45 646 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms