RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 RDH13Q8NBN7 331 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.89■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TISP43B9A030 160 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM253P0C7T8 217 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 DLG4P78352 724 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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SUMO3-204ENST00000411651 BSNDQ8WZ55 320 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 BTBD7Q9P203 1132 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SLC25A27O95847 323 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 KRT39Q6A163 491 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.092e-7■■■■□ 21.5
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SUMO3-204ENST00000411651 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF302Q9NR11 478 aa21.88■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 OATP04181 439 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ADRB2P07550 413 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 GPS2Q13227 327 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TCEAL1Q15170 157 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 PBKQ96KB5 322 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 FAM81BQ96LP2 452 aa21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TNFRSF8P28908 595 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 NF2P35240 595 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 GPC3P51654 580 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 PRKG1Q13976 671 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 NEDD9Q14511 834 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 RFFLQ8WZ73 363 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 NCK2O43639 380 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 PIGRP01833 764 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 RFC5P40937 340 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 GCLMP48507 274 aa21.86■■□□□ 1.09
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SUMO3-204ENST00000411651 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.86■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ADM5C9JUS6 153 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.097e-6■■■■■ 33.7
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SUMO3-204ENST00000411651 RPS6KA1Q15418 735 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 GPD1LQ8N335 351 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TAF4BQ92750 862 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 PORCNQ9H237 461 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ACBD3Q9H3P7 528 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 RNF181Q9P0P0 153 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.85■■□□□ 1.09
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SUMO3-204ENST00000411651 SIP14410 1827 aa21.85■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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SUMO3-204ENST00000411651 FTCDO95954 541 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 NAMPTP43490 491 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 GALCP54803 685 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 CNTN2Q02246 1040 aa21.84■■□□□ 1.09
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SUMO3-204ENST00000411651 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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SUMO3-204ENST00000411651 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD62A6NC57 917 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 TNFAIP3P21580 790 aa21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SUMO3-204ENST00000411651 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.84■■□□□ 1.09
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