RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 MYO9BQ13459 2157 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 A0A0U1RQF3 1178 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 AXLP30530 894 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 SLC12A3P55017 1021 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 SV2BQ7L1I2 683 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 DEPTORQ8TB45 409 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC51Q96ER9 411 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.94■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 GUCY2CP25092 1073 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 NOTUMQ6P988 496 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 GPBP1Q86WP2 473 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 ABI1Q8IZP0 508 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 RNF169Q8NCN4 708 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.93■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 TSPAN1O60635 241 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 HIP1RO75146 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 EOMESO95936 686 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 SLFN14P0C7P3 912 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 BSNDQ8WZ55 320 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 TNMDQ9H2S6 317 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.92■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 MYH11P35749 1972 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF202O95125 648 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CTNNB1P35222 781 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 AMPD3Q01432 767 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 SPRED2Q7Z698 418 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM192Q8IY95 271 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.91■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 EPOPA6NHQ4 379 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 FGFR1P11362 822 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 IGFBP4P22692 258 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 MCM4P33991 863 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 GATMP50440 423 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 EFNA5P52803 228 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 MAPK6Q16659 721 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 EPC2Q52LR7 807 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CNNM3Q8NE01 707 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.9■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.89■■□□□ 1.26
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF623O75123 536 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 LIG1P18858 919 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 AMHR2Q16671 573 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 FAM187BQ17R55 369 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 LONRF3Q496Y0 759 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC43Q8N309 656 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 PGBD4Q96DM1 585 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.89■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 KINO60870 393 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 NR1I2O75469 434 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 PRKCBP05771 671 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 RB1P06400 928 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 PEX3P56589 373 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 MAPK7Q13164 816 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 ADGRE1Q14246 886 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 KANK3Q6NY19 840 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 HACE1Q8IYU2 909 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 DAW1Q8N136 415 aa22.88■■□□□ 1.25
C4orf48-201ENST00000409248 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms