RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 NLRP4Q96MN2 994 aa22.42■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 MYL3P08590 195 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TFDP1Q14186 410 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 FIGNQ5HY92 759 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 IQCDQ96DY2 449 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 STX10O60499 249 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 EFNA5P52803 228 aa22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 A0A1W2PQJ5 194 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 EPHB6O15197 1021 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 F2P00734 622 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM49P0CI25 452 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM49CP0CI26 452 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 GARTP22102 1010 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM32Q13049 653 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 KAT2BQ92831 832 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.4■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 ASAP2O43150 1006 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 ARHGAP6O43182 974 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 ADRB2P07550 413 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TMOD1P28289 359 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 VAMP7P51809 220 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 ZBED6P86452 979 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 MFSD10Q14728 455 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 SETD4Q9NVD3 440 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 AKT3Q9Y243 479 aa22.39■■□□□ 1.18
TRIM4-202ENST00000354241 MAPK13O15264 365 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 PIGRP01833 764 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 EDN1P05305 212 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 GPD1LQ8N335 351 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.39■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 PRKCBP05771 671 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 ELNP15502 786 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 FMO5P49326 533 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 PSEN2P49810 448 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 GBP6Q6ZN66 633 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 DNAJC7Q99615 494 aa22.38■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 HOXD10P28358 340 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 DLG4P78352 724 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MAPK6Q16659 721 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SRRDQ9UH36 339 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 VTNP04004 478 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SLC9A1P19634 815 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 KCNJ6P48051 423 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 APBA1Q02410 837 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 GCNT4Q9P109 453 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.37■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MYADML2A6NDP7 307 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 GPR25O00155 361 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MSCO60682 206 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CBWD6Q4V339 395 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 FBXL18Q96ME1 805 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 MAP7D2Q96T17 732 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 CEP72Q9P209 647 aa22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRIM4-202ENST00000354241 SEPT4O43236 478 aa22.35■■□□□ 1.17
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