RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 DNAI1Q9UI46 699 aa20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ADCY3O60266 1144 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PPFIA4O75335 1185 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ADRB2P07550 413 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MYL7Q01449 175 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SREBF2Q12772 1141 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 GNG11P61952 73 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 HGSNATQ68CP4 663 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PIGRP01833 764 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SERPING1P05155 500 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 HOXC6P09630 235 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PPP3CAQ08209 521 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 GPD1LQ8N335 351 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SPAG5Q96R06 1193 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 DEF6Q9H4E7 631 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 USP20Q9Y2K6 914 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.87■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 P4HA2O15460 535 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 CETN1Q12798 172 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MYO6Q9UM54 1294 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 INSRRP14616 1297 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP25P42331 645 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 GCLMP48507 274 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 KIF11P52732 1056 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 EFNA5P52803 228 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 CRHR2Q13324 411 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SPA17Q15506 151 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 USP6NLQ92738 828 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.86■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 AKR1B10O60218 316 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 KIF5CO60282 957 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ABL1P00519 1130 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ZNF286BP0CG31 522 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 CYP27A1Q02318 531 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TNFAIP2Q03169 654 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 IQCEQ6IPM2 695 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 GJB7Q6PEY0 223 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 WDR24Q96S15 920 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ZNF263O14978 683 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 FANCGO15287 622 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ADCY6O43306 1168 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 LCA5LO95447 670 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 MMP3P08254 477 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TM4SF4P48230 202 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ARID5AQ03989 594 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 IRF5Q13568 498 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 ASIC2Q16515 512 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 METTL13Q8N6R0 699 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 RNF149Q8NC42 400 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 LMO3Q8TAP4 145 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 TMC2Q8TDI7 906 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.84■□□□□ 0.93
UPP1-201ENST00000331803 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms