RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 SNHG28P0DPA3 235 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MYBL1P10243 752 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 BPIFB4P59827 614 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CENPCQ03188 943 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PPATQ06203 517 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GIT2Q14161 759 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 KIF22Q14807 665 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CNGA2Q16280 664 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC35C1Q96A29 364 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GGA1Q9UJY5 639 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ALG6Q9Y672 507 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLIT2O94813 1529 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SKIP12755 728 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 IFNAR2P48551 515 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC12A3P55017 1021 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 KLRC3Q07444 240 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CYP1B1Q16678 543 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 AOC3Q16853 763 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SGO2Q562F6 1265 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 LIN9Q5TKA1 542 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZNF398Q8TD17 642 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLCO2A1Q92959 643 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MBOAT7Q96N66 472 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TIPINQ9BVW5 301 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SPON1Q9HCB6 807 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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LMO3-202ENST00000320122 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ITGA4P13612 1032 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ALADP13716 330 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 BRAFP15056 766 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ARHGAP4P98171 946 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 BNIP1Q12981 228 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 IKQ13123 557 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.92□□□□□ -1.3
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LMO3-202ENST00000320122 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ART4Q93070 314 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SPDL1Q96EA4 605 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FAM212AQ96EL1 285 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NENFQ9UMX5 172 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 UBOX5O94941 541 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GJB6O95452 261 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ACTN1P12814 892 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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LMO3-202ENST00000320122 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MDM1Q8TC05 714 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 LRRC8CQ8TDW0 803 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 LRRC15Q8TF66 581 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TMEM237Q96Q45 408 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 REEP2Q9BRK0 252 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 MYH1P12882 1939 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 TMEM120BA0PK00 339 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 F8W031 263 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 G3V3G9 751 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 ABHD2P08910 425 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 GSTA2P09210 222 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PHBP35232 272 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 CCNG1P51959 295 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 NCALDP61601 193 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 PRR16Q569H4 304 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-202ENST00000320122 HHATQ5VTY9 493 aa6.91□□□□□ -1.3
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