RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264993.7

CDV3-201, Transcript of CDV3 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDV3, Length 3,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3-201ENST00000264993 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 CLDN3O15551 220 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 CALB2P22676 271 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 GNA11P29992 359 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 PTENP60484 403 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 MYH4Q9Y623 1939 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 ANKRD62A6NC57 917 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 FOXN2P32314 431 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 JDP2Q8WYK2 163 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 CNKSR1Q969H4 720 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 SCOCQ9UIL1 159 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.59■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 PEX11AO75192 247 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 PSMC6P62333 389 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 VPS72Q15906 364 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 PRELID2Q8N945 189 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 RIC8AQ9NPQ8 531 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 SMAPO00193 183 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 CHMP2AO43633 222 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 ADCY8P40145 1251 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 RCAN1P53805 252 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 DEUP1Q05D60 604 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 IQCDQ96DY2 449 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 PGM2Q96G03 612 aa21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
CDV3-201ENST00000264993 RFC4P35249 363 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 STK32AQ8WU08 396 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 COG5Q9UP83 839 aa21.58■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 GLI3P10071 1580 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L15C9J2P7 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L11C9JVI0 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L18D6R9N7 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L22D6RA61 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L19D6RCP7 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L20D6RJB6 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 TPBGLP0DKB5 382 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PYGBP11216 843 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 ICA1Q05084 483 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L24Q0WX57 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 CFAP157Q5JU67 520 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 VSTM1Q6UX27 236 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 CAPN9O14815 690 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 AHCYL1O43865 530 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 UNC5CO95185 931 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 HIPK4Q8NE63 616 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 MCUR1Q96AQ8 359 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 TTC1Q99614 292 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 A6NHS1 94 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PYGMP11217 842 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PPP1R2P41236 205 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 CUL3Q13618 768 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 VPS52Q8N1B4 723 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 VCXQ9H320 206 aa21.57■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 COG2Q14746 738 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 FESP07332 822 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 CETPP11597 493 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 CACNA2D1P54289 1103 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 PICALMQ13492 652 aa21.56■■□□□ 1.04
CDV3-201ENST00000264993 SEPT2Q15019 361 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms