RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262631.10

SCN1B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN1B, Length 1,670 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1B-201ENST00000262631 GHRP10912 638 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 CYP2C18P33260 490 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 LPIN1Q14693 890 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 GPNMBQ14956 572 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 FAM228AQ86W67 206 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 HVCN1Q96D96 273 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 KCTD10Q9H3F6 313 aa26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SCN1B-201ENST00000262631 TISP43B9A030 160 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ITGB8P26012 769 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 STRN3Q13033 797 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ACCSQ96QU6 501 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SEMA6BQ9H3T3 888 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 UBE4BO95155 1302 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ACKR2O00590 384 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TGFB1I1O43294 461 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SCP2P22307 547 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CCL23P55773 120 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ZNF445P59923 1031 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 FAM187BQ17R55 369 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SCLYQ96I15 445 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 MED15Q96RN5 788 aa26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TSPAN1O60635 241 aa26.75■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SLC39A4Q6P5W5 647 aa26.75■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.75■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.75■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.75■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ALPK3Q96L96 1907 aa26.75■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 KIAA0355O15063 1070 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ABCD1P33897 745 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 STIM1Q13586 685 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SYCP3Q8IZU3 236 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CPB2Q96IY4 423 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TMEM206Q9H813 350 aa26.74■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TRIM49BA6NDI0 452 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ANKRD63C9JTQ0 380 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PSMA7O14818 248 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 NBNO60934 754 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 RPS6KA5O75582 802 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CD52P31358 61 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 NELFBQ8WX92 580 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ERLIN2O94905 339 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 KIF20AO95235 890 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 STX17P56962 302 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ZCWPW2Q504Y3 356 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CENPPQ6IPU0 288 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 BICD1Q96G01 975 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PADI3Q9ULW8 664 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.73■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PIGRP01833 764 aa26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PAK1Q13153 545 aa26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 P2RX5Q93086 422 aa26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 GBP3Q9H0R5 595 aa26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 EXOC7Q9UPT5 735 aa26.72■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TIMP1P01033 207 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PPP1R2P41236 205 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ANKRD40Q6AI12 368 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 DACH1Q9UI36 760 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 SQORQ9Y6N5 450 aa26.71■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 CCNE1P24864 410 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ADSSP30520 456 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 LIG4P49917 911 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PAK2Q13177 524 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 EEF1DP3Q658K8 133 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TTI2Q6NXR4 508 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 ZPBP2Q6X784 338 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 HAPLN2Q9GZV7 340 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SCN1B-201ENST00000262631 PDXKO00764 312 aa26.7■■□□□ 1.86
SCN1B-201ENST00000262631 RAG1P15918 1043 aa26.7■■□□□ 1.86
SCN1B-201ENST00000262631 USP38Q8NB14 1042 aa26.7■■□□□ 1.86
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