RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf53Q5VUE5 145 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RX5Q93086 422 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 LCMT1Q9UIC8 334 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NNZ2 444 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 PES1O00541 588 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ENC1O14682 589 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SYN1P17600 705 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SPA17Q15506 151 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB8Q3ZCM7 444 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 RIT2Q99578 217 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 AMPD3Q01432 767 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNT9Q6UX72 402 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR81Q562E7 1941 aa28.7■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALT4O60513 344 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FAAP100Q0VG06 881 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GLG1Q92896 1179 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf25Q9BPX7 421 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 VAV3Q9UKW4 847 aa28.7■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 EML1O00423 815 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TACC1O75410 805 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SWSAP1Q6NVH7 229 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GBP6Q6ZN66 633 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR9Q96QG7 549 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMM50Q9Y512 469 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PHACTR2O75167 634 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LGR5O75473 907 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 IDEP14735 1019 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO7P57737 925 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CALCRLQ16602 461 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1EQ8WY54 764 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CLSTN1O94985 981 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SELENOOQ9BVL4 669 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX12Q9UMY4 172 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP4AP20648 1035 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB8P26012 769 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TXKP42681 527 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT76Q01546 638 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 UGCGQ16739 394 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC42Q96M95 316 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM20AQ96MK3 541 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 RSPH14Q9UHP6 348 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH6O60337 910 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LCA5LO95447 670 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CD4P01730 458 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CNNM4Q6P4Q7 775 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM76AQ8TAV0 307 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa28.67■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 BACH1O14867 736 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM66O15016 1216 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TCP1P17987 556 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 STAT5BP51692 787 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NFRKBQ6P4R8 1299 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LACRTQ9GZZ8 138 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAGL2Q9UPG8 496 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 EMSYQ7Z589 1322 aa28.66■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2C9P11712 490 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf31Q8N865 590 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD4Q9NVD3 440 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6BA6NDN3 693 aa28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms