RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 C4orf19Q8IY42 314 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 PGBD4Q96DM1 585 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 THEGQ9P2T0 379 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ALDH1A1P00352 501 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CCT5P48643 541 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 LRRC31Q6UY01 552 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RDH13Q8NBN7 331 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 URGCPQ8TCY9 931 aa6.77□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 GPC3P51654 580 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 BACE1P56817 501 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SLIT2O94813 1529 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ITIH2P19823 946 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ERO1BQ86YB8 467 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SERPINI1Q99574 410 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RNF146Q9NTX7 359 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TLDC2A0PJX2 215 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ZNF699Q32M78 642 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 VPS39Q96JC1 886 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 P3H1Q32P28 736 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 KLC3Q6P597 504 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SEPT14Q6ZU15 432 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CYP3A4P08684 503 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 MSH2P43246 934 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SP4Q02446 784 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 GUCY2DQ02846 1103 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SGK1O00141 431 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 PCSK2P16519 638 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 GNA15P30679 374 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 STAT4Q14765 748 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 KCTD6Q8NC69 237 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ST7Q9NRC1 585 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 EXTL3O43909 919 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 AXLP30530 894 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TSPY1Q01534 308 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN26Q16670 478 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ITPK1Q13572 414 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CENPPQ6IPU0 288 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 MMP19Q99542 508 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.76□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 EHHADHQ08426 723 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 GEN1Q17RS7 908 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 GCNAQ96QF7 691 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CYP3A7P24462 503 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 SCARF1Q14162 830 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 CASP8Q14790 479 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 NTRK3Q16288 839 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RAD17O75943 681 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 PI16Q6UXB8 463 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ZPBP2Q6X784 338 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 NCAM2O15394 837 aa6.75□□□□□ -1.33
SETX-201ENST00000224140 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms