RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220429.12

GABPB1-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1, Length 2,726 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-201ENST00000220429 UBE2SQ16763 222 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DACT2Q5SW24 774 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CHADLQ6NUI6 762 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.65□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 USP17L10C9JJH3 530 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PEX11AO75192 247 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 IQCDQ96DY2 449 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 INTUQ9ULD6 942 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TTC26A0AVF1 554 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TMEM247A6NEH6 219 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 KRT38O76015 456 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MMEP08473 750 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CCNFP41002 786 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 HDAC4P56524 1084 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 GRB10Q13322 594 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TTI2Q6NXR4 508 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 WDR59Q6PJI9 974 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ERMNQ8TAM6 284 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MTMR8Q96EF0 704 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CCDC17Q96LX7 622 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DNAJC7Q99615 494 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.64□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PSMA7O14818 248 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ZBTB5O15062 677 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ECE2O60344 883 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SHBGP04278 402 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SPATA31D3P0C874 917 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TNNI2P48788 182 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ASIC1P78348 528 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 STK4Q13043 487 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 RCN2Q14257 317 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TRADDQ15628 312 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 IQCF2Q8IXL9 164 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 STKLD1Q8NE28 680 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.078e-6■■■■□ 19.7
GABPB1-201ENST00000220429 LRRC45Q96CN5 670 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MRIQ9BWK5 157 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ASLP04424 464 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PDE4DQ08499 809 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CALML4Q96GE6 196 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TRIM47Q96LD4 638 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 PNMA5Q96PV4 448 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.63□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 FCER1AP12319 257 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 UBXN1Q04323 297 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 USH1GQ495M9 461 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 MYOCDQ8IZQ8 938 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ZNF333Q96JL9 665 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 IDI2Q9BXS1 227 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 THAP9Q9H5L6 903 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 INIPQ9NRY2 104 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 EXOC1Q9NV70 894 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 A0A0J9YVX5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 POTEMA6NI47 508 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 H0YIN7 160 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 TJP3O95049 919 aa14.62□□□□□ -0.07
GABPB1-201ENST00000220429 ITGA2BP08514 1039 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms