RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000008440.9

SPRTN-201, Transcript of SprT-like N-terminal domain, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPRTN, Length 1,667 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTN-201ENST00000008440 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa23.5■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.5■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ERLIN2O94905 339 aa23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 AMHR2Q16671 573 aa23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PADI3Q9ULW8 664 aa23.49■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 HOXD13P35453 343 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PRCPP42785 496 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PAK2Q13177 524 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 CPB2Q96IY4 423 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ACKR2O00590 384 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TSPAN1O60635 241 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 CSF2RAP15509 400 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ALCAMQ13740 583 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 MFSD5Q6N075 450 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 BICD1Q96G01 975 aa23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 CD44P16070 742 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 NLRP12P59046 1061 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 FAM187BQ17R55 369 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 DPCR1Q3MIW9 517 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 USP38Q8NB14 1042 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 BADQ92934 168 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ACCSQ96QU6 501 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 SQORQ9Y6N5 450 aa23.47■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TRIP11Q15643 1979 aa23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 GPR182O15218 404 aa23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 KCNN1Q92952 543 aa23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 HVCN1Q96D96 273 aa23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.45■■□□□ 1.35
SPRTN-201ENST00000008440 TISP43B9A030 160 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 SCP2P22307 547 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ABCD1P33897 745 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 BMT2Q1RMZ1 405 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM199Q8N511 208 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.45■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ADSSL1Q8N142 457 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 VWCEQ96DN2 955 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 TMX1Q9H3N1 280 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 UBE4BO95155 1302 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 CXCL10P02778 98 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 LIG4P49917 911 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 TYRO3Q06418 890 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 TCTN1Q2MV58 587 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM206Q9H813 350 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 CITO14578 2027 aa23.44■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ACRP10323 421 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 RFC2P35250 354 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.43■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 MGEA5O60502 916 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 STIM1Q13586 685 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 SEPT8Q92599 483 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 GBP3Q9H0R5 595 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.42■■□□□ 1.34
SPRTN-201ENST00000008440 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.42■■□□□ 1.34
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