RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.12■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PFASO15067 1338 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CCND1P24385 295 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 KCNV2Q8TDN2 545 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CNKSR1Q969H4 720 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 UPP2O95045 317 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 GH1P01241 217 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 SOX5P35711 763 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 STAT1P42224 750 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MSH2P43246 934 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ZNF131P52739 623 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 VSTM1Q6UX27 236 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 GPR88Q9GZN0 384 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.11■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 LY75O60449 1722 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TMEM120BA0PK00 339 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MGAT5Q09328 741 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 POTEAQ6S8J7 498 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ASRGL1Q7L266 308 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CCDC25Q86WR0 208 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 BAG3O95817 575 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CGB2Q6NT52 195 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 USP40Q9NVE5 1235 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 GDAP1Q8TB36 358 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PPP4CP60510 307 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R5EQ16537 467 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ENO4A6NNW6 628 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 PDXKO00764 312 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 SUN1O94901 812 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 LMNB1P20700 586 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 POLD1P28340 1107 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 BTDP43251 543 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MPP2Q14168 576 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MFSD5Q6N075 450 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 ALG6Q9Y672 507 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-222ENST00000639501 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 GJB6O95452 261 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SPATA21Q7Z572 469 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.08■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 KIF3CO14782 793 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ACSL3O95573 720 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SLC16A2P36021 539 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 KCNJ1P48048 391 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 NOVP48745 357 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 BORCS6Q96GS4 357 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L15C9J2P7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L11C9JVI0 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L18D6R9N7 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L22D6RA61 530 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-222ENST00000639501 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.07■■□□□ 1.12
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