RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623297.1

CU639417.6-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU639417.6, Length 3,013 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.6-201ENST00000623297 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 MYCT1Q8N699 235 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 SPDL1Q96EA4 605 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 ANO3Q9BYT9 981 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 DNM3Q9UQ16 869 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 PDIA5Q14554 519 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 CCDC125Q86Z20 511 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 CERS5Q8N5B7 392 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 C3orf20Q8ND61 904 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 SLC16A10Q8TF71 515 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 SNED1Q8TER0 1413 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 PLCG2P16885 1265 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 SEPT2Q15019 361 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 ASPRV1Q53RT3 343 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 NEK9Q8TD19 979 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 CEP63Q96MT8 703 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CU639417.6-201ENST00000623297 CFBP00751 764 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 AOC3Q16853 763 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM167BQ9BTA0 163 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 TAS2R14Q9NYV8 317 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PNMA3Q9UL41 463 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PPFIA2O75334 1257 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 AFPP02771 609 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 HOOK3Q86VS8 718 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PALB2Q86YC2 1186 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ERP44Q9BS26 406 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.08■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 RTN2O75298 545 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 MYBL1P10243 752 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 DPEP1P16444 411 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 GCKP35557 465 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 GDAP1Q8TB36 358 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 LRRC27Q9C0I9 530 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 NAV1Q8NEY1 1877 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 GHRP10912 638 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 MARCKSL1P49006 195 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ARHGAP4P98171 946 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 SLFN13Q68D06 897 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ALG3Q92685 438 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 HES6Q96HZ4 224 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ECT2Q9H8V3 914 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ACP6Q9NPH0 428 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.07■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM86B1E9PN63 330 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 GNA14O95837 355 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 MMP13P45452 471 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 LONRF1Q17RB8 773 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 JAMLQ86YT9 394 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 TTLL6Q8N841 843 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 CES2O00748 559 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 ECE2O60344 883 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 EVI5O60447 810 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 KCNJ1P48048 391 aa16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CU639417.6-201ENST00000623297 CCDC174Q6PII3 467 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms