RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 IQCF3P0C7M6 154 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 KIZQ2M2Z5 673 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM60Q495X7 471 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 NME8Q8N427 588 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 USP20Q9Y2K6 914 aa23.05■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 ALPK3Q96L96 1907 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 DENND3A2RUS2 1198 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 CHRNA1P02708 482 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 DEPTORQ8TB45 409 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TBX20Q9UMR3 447 aa23.04■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TGFB1I1O43294 461 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 SMTNP53814 917 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TLE2Q04725 743 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TFDP1Q14186 410 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 AMHR2Q16671 573 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 ZCWPW2Q504Y3 356 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF410Q86VK4 478 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.03■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 RBL2Q08999 1139 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 FAAP100Q0VG06 881 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 FAM26DQ5JW98 314 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 CENPPQ6IPU0 288 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 KLHL10Q6JEL2 608 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 OSMRQ99650 979 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 FZD8Q9H461 694 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TSPY26PQ9H489 355 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 CDY2AQ9Y6F7 541 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 UBE4BO95155 1302 aa23.02■■□□□ 1.28
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 TISP43B9A030 160 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 THPOP40225 353 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 PHKA2P46019 1235 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ALCAMQ13740 583 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 IQCB1Q15051 598 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 TTI2Q6NXR4 508 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 NELFBQ8WX92 580 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 NLRP7Q8WX94 980 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 HVCN1Q96D96 273 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ABHD8Q96I13 439 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 TOX2Q96NM4 488 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.01■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CTSHP09668 335 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CKBP12277 381 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 FGFR4P22455 802 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CCNE1P24864 410 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 STX17P56962 302 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 NCAPHQ15003 741 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 P2RX5Q93086 422 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ACCSQ96QU6 501 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CBX8Q9HC52 389 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 NOD1Q9Y239 953 aa23■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 K7ERI5 159 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 B4GALT5O43286 388 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 PIGRP01833 764 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 EFNA5P52803 228 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 CDC42EP1Q00587 391 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 MBTPS1Q14703 1052 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 GPNMBQ14956 572 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 FAM187BQ17R55 369 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG3-202ENST00000617158 H0YCG3 227 aa22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms