RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	IL13RA1	P78552	427 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DSC2	Q02487	901 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	SEMA5A	Q13591	1074 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	NPNT	Q6UXI9	565 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DPF2	Q92785	391 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	HDAC10	Q969S8	669 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM209	Q96SK2	561 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	CGRRF1	Q99675	332 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	HTR1B	P28222	390 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	AK2	P54819	239 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	ANTXR2	P58335	489 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	CD83	Q01151	205 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	MGAT2	Q10469	447 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	IL10RA	Q13651	578 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DGKD	Q16760	1214 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	WDR48	Q8TAF3	677 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	VIPR1	P32241	457 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	IL12RB1	P42701	662 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	NRG3	P56975	720 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	TNIP3	Q96KP6	325 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PVT1-225	ENST00000617087	GOLIM4	O00461	696 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	MYL3	P08590	195 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	GLRB	P48167	497 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	TM4SF4	P48230	202 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	CACNB3	P54284	484 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	MAP3K12	Q12852	859 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	RNF220	Q5VTB9	566 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	GPR156	Q8NFN8	814 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	KAT5	Q92993	513 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	MYD88	Q99836	296 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	KCND1	Q9NSA2	647 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087		A0A088AWK7	358 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087		A0A1W2PR48	441 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	CAPN8	A6NHC0	703 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	SLC16A6	O15403	523 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM127	O75204	238 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	GLI1	P08151	1106 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	CYP2C8	P10632	490 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	MAP2K6	P52564	334 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	MGAT5	Q09328	741 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	ADAM9	Q13443	819 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	SEPT2	Q15019	361 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	PHF19	Q5T6S3	580 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	SRL	Q86TD4	932 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	TTC7B	Q86TV6	843 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	KRT78	Q8N1N4	520 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	STPG3	Q8N7X2	389 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	DYDC2	Q96IM9	177 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	SYT3	Q9BQG1	590 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PVT1-225	ENST00000617087	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		6.95	□□□□□ -1.3

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