RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KAT6AQ92794 2004 aa2.81□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GAGE12BA1L429 117 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZBTB7CA1YPR0 619 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GAGE12HA6NDE8 117 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MYADML2A6NDP7 307 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MTSS1O43312 755 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RASGRP1O95267 797 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRLP01236 227 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FNTBP49356 437 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BCAR1P56945 870 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DDB1Q16531 1140 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAN2A1Q16706 1144 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MTERF2Q49AM1 385 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRR16Q569H4 304 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TTC38Q5R3I4 469 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CCDC62Q6P9F0 684 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM83AQ86UY5 434 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MCF2L2Q86YR7 1114 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARHGEF19Q8IW93 802 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CAGE1Q8TC20 777 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAML3Q96JK9 1138 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDCD2LQ9BRP1 358 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NDC1Q9BTX1 674 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BOCQ9BWV1 1114 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NDOR1Q9UHB4 597 aa2.8□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM200CA6NKL6 621 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AHRRA9YTQ3 701 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IKBKBO14920 756 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KLF4O43474 513 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DNAJC6O75061 913 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRT37O76014 449 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 STC2O76061 302 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FSBPO95073 299 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NDUFA10O95299 355 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NPTXRO95502 500 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HLA-DOAP06340 250 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MXRA7P84157 204 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GUCY1B3Q02153 619 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 VPS72Q15906 364 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM214AQ32MH5 1076 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FSTL4Q6MZW2 842 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GDF7Q7Z4P5 450 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NME9Q86XW9 330 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PLXDC1Q8IUK5 500 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC9A6Q92581 669 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DHRS4Q9BTZ2 278 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 AKIP1Q9NQ31 210 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PFDN2Q9UHV9 154 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TLK1Q9UKI8 766 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CLCA2Q9UQC9 943 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDPK1O15530 556 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADCY3O60266 1144 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NCR1O76036 304 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPATA31D3P0C874 917 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TYRP1P17643 537 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BMPR1AP36894 532 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KIF11P52732 1056 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SEC24CP53992 1094 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RAB33AQ14088 237 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ARHGAP44Q17R89 818 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPATC1Q76KD6 591 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OVCH1Q7RTY7 1134 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SIMC1Q8NDZ2 872 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR52N2Q8NGI0 321 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR5M3Q8NGP4 307 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LINC00476Q8WZB0 136 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LRFN3Q9BTN0 628 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DUSP26Q9BV47 211 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC29A3Q9BZD2 475 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRDM13Q9H4Q3 707 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCIF1Q9H4Z3 704 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KIAA1586Q9HCI6 787 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ACSS2Q9NR19 701 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SYBUQ9NX95 663 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RNF7Q9UBF6 113 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PIPSLA2A3N6 862 aa2.77□□□□□ -1.97
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa2.77□□□□□ -1.97
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DIRC3C9JPN6 131 aa2.77□□□□□ -1.97
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTH2RP49190 550 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms