RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 EPHA7Q15375 998 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 IER5Q5VY09 327 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP2R2DQ66LE6 453 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CLIC4Q9Y696 253 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TANC1Q9C0D5 1861 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM160A1Q05DH4 1040 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD7Q92527 254 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SEPT8Q92599 483 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD17B14Q9BPX1 270 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TMX1Q9H3N1 280 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.87□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SIP14410 1827 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS6KA5O75582 802 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PAK2Q13177 524 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SARM1Q6SZW1 724 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC8AQ8IWT6 810 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP89Q96ST8 783 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 LRWD1Q9UFC0 647 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TBX3O15119 743 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR32O75388 356 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CDC25BP30305 580 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNK18Q7Z418 384 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1024Q9UPX6 916 aa13.86□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 USP27XA6NNY8 438 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SMTNL1A8MU46 457 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 E9PMD0 336 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 RBL2Q08999 1139 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 USP49Q70CQ1 688 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM228AQ86W67 206 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM167AQ96KS9 214 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 MSRAQ9UJ68 235 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GVL5 298 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 RINLQ6ZS11 566 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 AOPEPQ8N6M6 819 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC7A3Q8WY07 619 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CLIC6Q96NY7 704 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAM2Q99965 735 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ANO10Q9NW15 660 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHA7Q9UN72 937 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP131Q9UPN4 1083 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 STK24Q9Y6E0 443 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 NCOR1O75376 2440 aa13.85□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ENPP3O14638 875 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 GJB5O95377 273 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 RFC2P35250 354 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 EMC2Q15006 297 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 YME1L1Q96TA2 773 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PTPRSQ13332 1948 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC36A6NLP5 189 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 FGFR1P11362 822 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 TMOD1P28289 359 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PBX3P40426 434 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 GPC3P51654 580 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ADGRE1Q14246 886 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.84□□□□□ -0.19
RABGEF1-209ENST00000607882 MEIS3P2A8K0S8 358 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SFI1A8K8P3 1242 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 PFKMP08237 780 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 SKILP12757 684 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF149Q8NC42 400 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF217Q8TC41 542 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 GDPD5Q8WTR4 605 aa13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
RABGEF1-209ENST00000607882 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms