RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592253.5

ITGA2B-208, Transcript of integrin subunit alpha 2b, human

TSL 4

Gene ITGA2B, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA2B-208	ENST00000592253	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	LIG1	P18858	919 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	STAT6	P42226	847 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	NAMPT	P43490	491 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SPATA32	Q96LK8	384 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PEX3	P56589	373 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PDILT	Q8N807	584 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TSPAN1	O60635	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	DGKI	O75912	1065 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRKCB	P05771	671 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SKI	P12755	728 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	AXL	P30530	894 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	DDIT3	P35638	169 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TAP1	Q03518	808 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	MAPK6	Q16659	721 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	DAW1	Q8N136	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253		A0A087X0B3	334 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	B4GALT5	O43286	388 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	HOXA2	O43364	376 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM13A	O94988	1023 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	FGFR1	P11362	822 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	NPTX2	P47972	431 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	GATM	P50440	423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	RAB27A	P51159	221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	EFNA5	P52803	228 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM189B	P81408	668 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	MAPK7	Q13164	816 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	AMHR2	Q16671	573 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	LONRF3	Q496Y0	759 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ABI1	Q8IZP0	508 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	DHX58	Q96C10	678 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA2B-208	ENST00000592253	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms