RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CPA4Q9UI42 421 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM17Q9Y577 477 aa8.91□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 NRDCO43847 1150 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ALBP02768 609 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP2C8P10632 490 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GUCY1A2P33402 732 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 HTR3AP46098 478 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PRMT2P55345 433 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ALX1Q15699 326 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TREML2Q5T2D2 321 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 BRAPQ7Z569 592 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 USP25Q9UHP3 1055 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.9□□□□□ -0.98
EFTUD2-216ENST00000590105 DOCK2Q92608 1830 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ANO9A1A5B4 782 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 M0R082 166 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 HIP1O00291 1037 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 RGS13O14921 159 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MAFGO15525 162 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SIN3BO75182 1162 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 AKR1B1P15121 316 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PSMC4P43686 418 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TDO2P48775 406 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SCNN1BP51168 640 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PJA1Q8NG27 643 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ACER1Q8TDN7 264 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPRN2Q92932 1015 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 E2F7Q96AV8 911 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 C12orf42Q96LP6 360 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NAPBQ9H115 298 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SMIM22K7EJ46 135 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NEMP1O14524 444 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PGRP06401 933 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 EPHX1P07099 455 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 JMJD7P0C870 316 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 PYGMP11217 842 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TMPRSS15P98073 1019 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 COG2Q14746 738 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF11Q86T75 865 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 BVESQ8NE79 360 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC9Q92623 222 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 WNT8BQ93098 351 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 CORO1BQ9BR76 489 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 KLHL3Q9UH77 587 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 INTUQ9ULD6 942 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 OTOFQ9HC10 1997 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1W2PRG0 241 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 VSTM5A8MXK1 200 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 NOP56O00567 594 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 KPNA6O60684 536 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms