RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 FSD2A1L4K1 749 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 AMHP03971 560 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 STAT6P42226 847 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 PTENP60484 403 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 DEFB103AP81534 67 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 MCM6Q14566 821 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 PPP2R5AQ15172 486 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 DRC1Q96MC2 740 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 TSPY26PQ9H489 355 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 A0A087X0B3 334 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 HIP1RO75146 1068 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 NAMPTP43490 491 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 GPBP1Q86WP2 473 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 DAW1Q8N136 415 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC192P0DO97 292 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 FGFR4P22455 802 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 MAPK7Q13164 816 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 PDILTQ8N807 584 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 BSNDQ8WZ55 320 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 IFT74Q96LB3 600 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 ENPP3O14638 875 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 ARSHQ5FYA8 562 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CNNM3Q8NE01 707 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 PANK2Q9BZ23 570 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 DENND3A2RUS2 1198 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 KANK3Q6NY19 840 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 E2F4Q16254 413 aa22.22■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 REEP2Q9BRK0 252 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CUEDC2Q9H467 287 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 CHST12Q9NRB3 414 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 RGS18Q9NS28 235 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 ERLIN2O94905 339 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 GJB5O95377 273 aa22.21■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 DEPTORQ8TB45 409 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 TOP1MTQ969P6 601 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.21■■□□□ 1.15
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ATG4D-208ENST00000588667 PEX3P56589 373 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 RAB30Q15771 203 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 PBX4Q9BYU1 374 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.2■■□□□ 1.15
ATG4D-208ENST00000588667 SZT2Q5T011 3432 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 PLS3P13797 630 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 NPTX2P47972 431 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4D-208ENST00000588667 DHX58Q96C10 678 aa22.2■■□□□ 1.14
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