RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ATP1A2P50993 1020 aa16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 GALCP54803 685 aa16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 HS2ST1Q7LGA3 356 aa16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 TEKT3Q9BXF9 490 aa16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
CTIF-205ENST00000587860 PIK3CDO00329 1044 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PEX3P56589 373 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 RPS6P62753 249 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 RPS6KA1Q15418 735 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 NIM1KQ8IY84 436 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 FAM107BQ9H098 131 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ACBD3Q9H3P7 528 aa16.33■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 NACC1Q96RE7 527 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ETAA1Q9NY74 926 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 CCDC169A6NNP5 214 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MAPK7Q13164 816 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 NAA25Q14CX7 972 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 METTL13Q8N6R0 699 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TAF4BQ92750 862 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 EMSYQ7Z589 1322 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PPP3CAQ08209 521 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PPP2R5CQ13362 524 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 EPC2Q52LR7 807 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 C2CD6Q53TS8 623 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 POTEAQ6S8J7 498 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PEX26Q7Z412 305 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 FAM71BQ8TC56 605 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 AMACRQ9UHK6 382 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 BACH1O14867 736 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 STAT1P42224 750 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MTMR1Q13613 665 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TATDN2Q93075 761 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 IQCDQ96DY2 449 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 BTBD6Q96KE9 485 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 THAP2Q9H0W7 228 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MYOZ2Q9NPC6 264 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 OLFML3Q9NRN5 406 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.31■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 H2AFZP0C0S5 128 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 H2AFVQ71UI9 128 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB10Q96DT7 871 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 DPH5Q9H2P9 285 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 CEP350Q5VT06 3117 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 F8VZ95 297 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 KIF4AO95239 1232 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 MYL7Q01449 175 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TKFCQ3LXA3 575 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 SUPT20HQ8NEM7 779 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ATG4CQ96DT6 458 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TUFT1Q9NNX1 390 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 ZNRF3Q9ULT6 936 aa16.3■□□□□ 0.2
CTIF-205ENST00000587860 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms