RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMPD3Q01432 767 aa36.58■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DYMQ7RTS9 669 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM87AQ8NBN3 555 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP25Q9UHP3 1055 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMA3Q16787 3333 aa36.57■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF131P52739 623 aa36.57■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa36.57■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 PARVGQ9HBI0 331 aa36.57■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC17AQ6ZS10 378 aa36.55■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIRE2Q8WWL2 714 aa36.55■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01599Q8WXQ3 324 aa36.55■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC19Q96DA6 116 aa36.55■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIFC3Q9BVG8 833 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa36.54■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB103AP81534 67 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSC3Q14574 896 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM2Q99965 735 aa36.54■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa36.54■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRIMPOLQ96LW4 560 aa36.53■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZHX3Q9H4I2 956 aa36.53■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS18Q9NS28 235 aa36.53■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DACT1Q9NYF0 836 aa36.52■■■■□ 3.44
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa36.52■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF202O95125 648 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 AXLP30530 894 aa36.5■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YCG3 227 aa36.49■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM160A1Q05DH4 1040 aa36.48■■■■□ 3.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PAGE5Q96GU1 130 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAIPQ9BWF2 469 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9IYK1 514 aa36.47■■■■□ 3.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACKR2O00590 384 aa36.47■■■■□ 3.43
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