RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 ACTRT1Q8TDG2 376 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RNF146Q9NTX7 359 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.17■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TMEM253P0C7T8 217 aa25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PEX3P56589 373 aa25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 XKR9Q5GH70 373 aa25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PLA2G4FQ68DD2 849 aa25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 EPB41L5Q9HCM4 733 aa25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RIPK3Q9Y572 518 aa25.16■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 MAPK13O15264 365 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 P4HA2O15460 535 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CEP104O60308 925 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 BACE1P56817 501 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GUCY2DQ02846 1103 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NNTQ13423 1086 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 EPC2Q52LR7 807 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 METTL13Q8N6R0 699 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TNFAIP3P21580 790 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 GCLMP48507 274 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CARSP49589 748 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 DAAM2Q86T65 1068 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHO2Q8TD55 490 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 SCFD2Q8WU76 684 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 RFFLQ8WZ73 363 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 BCS1LQ9Y276 419 aa25.15■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 LRRN2O75325 713 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CETN1Q12798 172 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 DCAF15Q66K64 600 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 IWS1Q96ST2 819 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
EHD4-202ENST00000569223 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa25.14■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 RAD51CO43502 376 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB7AO95365 584 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 CCND2P30279 289 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 PAK2Q13177 524 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 REPS2Q8NFH8 660 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 OSGEPQ9NPF4 335 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 NFU1Q9UMS0 254 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ESYT3A0FGR9 886 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 RDM1Q8NG50 284 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 HES6Q96HZ4 224 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ARID2Q68CP9 1835 aa25.13■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ADRB2P07550 413 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 PALB2Q86YC2 1186 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 RASGEF1CQ8N431 466 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 VTI1AQ96AJ9 217 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 GPRASP2Q96D09 838 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 AGPAT1Q99943 283 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 TAS2R14Q9NYV8 317 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ABCB4P21439 1286 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 PPATQ06203 517 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ANO5Q75V66 913 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 IFT81Q8WYA0 676 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF26Q96DR7 871 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 AMFRQ9UKV5 643 aa25.12■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 NR3C2P08235 984 aa25.11■■□□□ 1.61
EHD4-202ENST00000569223 CAPN2P17655 700 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms