RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 TCF25Q9BQ70 676 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 CLEC1BQ9P126 229 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP4C-211ENST00000567642 FSCN2O14926 492 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SLITRK3O94933 977 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 GLP2RO95838 553 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 MTRQ99707 1265 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 WNT7AO00755 349 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 GAS2O43903 313 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP6Q16828 381 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TMC7Q7Z402 723 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 C5orf42Q9H799 3197 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ASAP2O43150 1006 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ALADP13716 330 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 CA8P35219 290 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 RAB27AP51159 221 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 BCAR1P56945 870 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 FERMT3Q86UX7 667 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 RNF149Q8NC42 400 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 C8orf76Q96K31 380 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 FSD2A1L4K1 749 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 C19orf67A6NJJ6 358 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 GPR37L1O60883 481 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 EYA4O95677 639 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 MCM7P33993 719 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 COASYQ13057 564 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 PGBD4Q96DM1 585 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 HIDE1A8MVS5 230 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF623O75123 536 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 LLGL2Q6P1M3 1020 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM169Q96HH4 297 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 MTMR9Q96QG7 549 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 DCXO43602 365 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ERLIN2O94905 339 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 GBP3Q9H0R5 595 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 A0A087WWV3 80 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 POTEMA6NI47 508 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 OFD1O75665 1012 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 LYPLA2O95372 231 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TECP42680 631 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TFDP1Q14186 410 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 URGCPQ8TCY9 931 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.33■■□□□ 1.33
PPP4C-211ENST00000567642 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 DGAT1O75907 488 aa23.32■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.32■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 RARRES1P49788 294 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 PTENP60484 403 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF174Q15697 407 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 VPS52Q8N1B4 723 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 APOL5Q9BWW9 433 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 RSAD1Q9HA92 442 aa23.31■■□□□ 1.32
PPP4C-211ENST00000567642 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa23.31■■□□□ 1.32
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