RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567228.1

E2F4-209, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene E2F4, Length 757 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-209ENST00000567228 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 NDUFV1P49821 464 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TMEM31Q5JXX7 168 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 FERMT3Q86UX7 667 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TPH2Q8IWU9 490 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 LPPQ93052 612 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 HIDE1A8MVS5 230 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 MARCH6O60337 910 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 OFD1O75665 1012 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 PPM1AP35813 382 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 EMC2Q15006 297 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 CALCRLQ16602 461 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 XKR9Q5GH70 373 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 UBXN11Q5T124 520 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 ASAP2O43150 1006 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 SKIP12755 728 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 BCAR1P56945 870 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 SUSD6Q92537 303 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TCF25Q9BQ70 676 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 S1PR5Q9H228 398 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.58■■□□□ 1.05
E2F4-209ENST00000567228 FAM86C2PA6NEL3 165 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 B4GALT3O60512 393 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 NEMFO60524 1076 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 ALADP13716 330 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 ARL2P36404 184 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 TXKP42681 527 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 RAB27AP51159 221 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 FOSBP53539 338 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 PTENP60484 403 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 KRT17Q04695 432 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 POU5F1BQ06416 359 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 LONRF3Q496Y0 759 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 C8orf34Q49A92 452 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 TCP11Q8WWU5 503 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 DCXO43602 365 aa21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 RNF149Q8NC42 400 aa21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 A0A087WWV3 80 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 FSD2A1L4K1 749 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 GALTP07902 379 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 RARRES1P49788 294 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 GUCY1B3Q02153 619 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 TRIM29Q14134 588 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 ZNF280BQ86YH2 543 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 MTRQ99707 1265 aa21.55■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 POTEMA6NI47 508 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 AMHR2Q16671 573 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 TMC7Q7Z402 723 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 RNF135Q8IUD6 432 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 IGSF21Q96ID5 467 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.54■■□□□ 1.04
E2F4-209ENST00000567228 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms