RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 SIP14410 1827 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ESPNB1AK53 854 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CASP4P49662 377 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TFDP1Q14186 410 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 METTL13Q8N6R0 699 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TRPV1Q8NER1 839 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 HTRA3P83110 453 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 LRMPQ12912 555 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 DRP2Q13474 957 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 SYCP1Q15431 976 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 SRRDQ9UH36 339 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 K7ERI5 159 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 GPR25O00155 361 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ASAP2O43150 1006 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ADCY3O60266 1144 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 F2P00734 622 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 MYL3P08590 195 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 KLRC1P26715 233 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CNGA1P29973 690 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 EFNA5P52803 228 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 GRIK4Q16099 956 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ERO1AQ96HE7 468 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 NUP58Q9BVL2 599 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 TISP43B9A030 160 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 GNRH1P01148 92 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 TMOD1P28289 359 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 LIG4P49917 911 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CLCN3P51790 818 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 RBL2Q08999 1139 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 ARHGEF6Q15052 776 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 IQCDQ96DY2 449 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 KRT13P13646 458 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 MFSD10Q14728 455 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CNGA4Q8IV77 575 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SPC25Q9HBM1 224 aa22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SEPT4O43236 478 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 KPNA6O60684 536 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 PSEN2P49810 448 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CHMP4BP1P59074 171 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 BEX3Q00994 111 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CAP1Q01518 475 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 KCNH2Q12809 1159 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 RNF149Q8NC42 400 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 MAPK13O15264 365 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 FKTNO75072 461 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 PIGRP01833 764 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 GYPCP04921 128 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 RARBP10826 455 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 GARTP22102 1010 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 KAT2BQ92831 832 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 CCDC51Q96ER9 411 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 BORCS6Q96GS4 357 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 NLRP4Q96MN2 994 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 MAP7D2Q96T17 732 aa22.49■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 MFAP3LO75121 409 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 SKILP12757 684 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 ELNP15502 786 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-208ENST00000566637 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms