RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 PP2D1A8MPX8 630 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 DLL1O00548 723 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 ITGB1P05556 798 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 HLA-CQ95604 372 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.7■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 TRANK1O15050 2925 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 CDC25AP30304 524 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 CAMK1Q14012 370 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC43Q8N309 656 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 RSPH1Q8WYR4 309 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 TSPAN1O60635 241 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 ERLIN2O94905 339 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 LAG3P18627 525 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 AXLP30530 894 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 TFF2Q03403 129 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 UBXN11Q5T124 520 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 HELQQ8TDG4 1101 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 SNX21Q969T3 373 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.68■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 SYT1P21579 422 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 DNAJB1P25685 340 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 AMHR2Q16671 573 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 AAK1Q2M2I8 961 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 LPPQ93052 612 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 PGBD4Q96DM1 585 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 DNM3Q9UQ16 869 aa23.67■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 FGF18O76093 207 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 EYA4O95677 639 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 UBE3AQ05086 875 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 LONRF3Q496Y0 759 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 POF1BQ8WVV4 589 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC51Q96ER9 411 aa23.66■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 E9PMD0 336 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 BMP15O95972 392 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 HYIQ5T013 277 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 NOTUMQ6P988 496 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 THNSL1Q8IYQ7 743 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 BSNDQ8WZ55 320 aa23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.64■■□□□ 1.38
RNPS1-218ENST00000566180 OFD1O75665 1012 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 COL19A1Q14993 1142 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 CNNM3Q8NE01 707 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 CPB2Q96IY4 423 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF558Q96NG5 402 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 CSRNP2Q9H175 543 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.64■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 BMP1P13497 986 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 IRS1P35568 1242 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 NAMPTP43490 491 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 PLCB3Q01970 1234 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 KCNK18Q7Z418 384 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 KIFAP3Q92845 792 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 AK8Q96MA6 479 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 PNMA5Q96PV4 448 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 FZD8Q9H461 694 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 ARID2Q68CP9 1835 aa23.63■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 A0A0C4DFX4 3053 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 B4GALT5O43286 388 aa23.62■■□□□ 1.37
RNPS1-218ENST00000566180 NCK2O43639 380 aa23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms