RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	EMC2	Q15006	297 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TCP11	Q8WWU5	503 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	PPME1	Q9Y570	386 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	GLP2R	O95838	553 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	RAB27A	P51159	221 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	DUSP6	Q16828	381 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TNFRSF25	Q93038	417 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	FSCN2	O14926	492 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB39	O15060	712 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	NEMF	O60524	1076 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SEC24B	O95487	1268 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TXK	P42681	527 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	COASY	Q13057	564 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	MTR	Q99707	1265 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	GBP3	Q9H0R5	595 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	HIDE1	A8MVS5	230 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	EYA4	O95677	639 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	BCAR1	P56945	870 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	GUCY1B3	Q02153	619 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF149	Q8NC42	400 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	PGBD4	Q96DM1	585 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM169	Q96HH4	297 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	TEC	P42680	631 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PPP4C-208	ENST00000564966	ERLIN2	O94905	339 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	SLITRK3	O94933	977 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	APOL5	Q9BWW9	433 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ASAP2	O43150	1006 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	URGCP	Q8TCY9	931 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM122A	Q96E09	287 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	MCM7	P33993	719 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF135	Q8IUD6	432 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	PRR33	A8MZF0	331 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	TFDP1	Q14186	410 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	C8orf76	Q96K31	380 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	WNT7A	O00755	349 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF623	O75123	536 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	OFD1	O75665	1012 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL14	O95715	111 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	VPS52	Q8N1B4	723 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ARID2	Q68CP9	1835 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	C5orf42	Q9H799	3197 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	POTEM	A6NI47	508 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ST3GAL1	Q11201	340 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	RSAD1	Q9HA92	442 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A087WWV3	80 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PPP4C-208	ENST00000564966	CARNS1	A5YM72	827 aa		28.2	■■■□□ 2.1

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