RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 SCFD1Q8WVM8 642 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 NLRP7Q8WX94 980 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 WNT8BQ93098 351 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DACH1Q9UI36 760 aa21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DENND3A2RUS2 1198 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R37O75864 691 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 KIF20AO95235 890 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R2P41236 205 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 GTF2BQ00403 316 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 POU5F1BQ06416 359 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZNF410Q86VK4 478 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ADSSL1Q8N142 457 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SCLT1Q96NL6 688 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 STRA6Q9BX79 667 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TSPY26PQ9H489 355 aa21.09■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 TET1Q8NFU7 2136 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 GPR32O75388 356 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PHKA2P46019 1235 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 PTENP60484 403 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 SNX17Q15036 470 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 KIZQ2M2Z5 673 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 RPAINQ86UA6 219 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.08■□□□□ 0.97
CTU2-204ENST00000564105 UBE4BO95155 1302 aa21.08■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 M0QZ92 97 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CD4P01730 458 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ABCD1P33897 745 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 HVCN1Q96D96 273 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 GINS2Q9Y248 185 aa21.07■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 K7ERI5 159 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 PSMA7O14818 248 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 SCP2P22307 547 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 THPOP40225 353 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 EFNA5P52803 228 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 KCNA1Q09470 495 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TRIM60Q495X7 471 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 KCNN1Q92952 543 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TBX20Q9UMR3 447 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 LAMA3Q16787 3333 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ANK1P16157 1881 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 HOXD13P35453 343 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TAS1R3Q7RTX0 852 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ACCSQ96QU6 501 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 OSMRQ99650 979 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.06■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CTSHP09668 335 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 STRN3Q13033 797 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 PAK1Q13153 545 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 NELFBQ8WX92 580 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TOX2Q96NM4 488 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TMEM206Q9H813 350 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.05■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CAND2O75155 1236 aa21.04■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CCNE1P24864 410 aa21.04■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 TLE2Q04725 743 aa21.04■□□□□ 0.96
CTU2-204ENST00000564105 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms