RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYBPC2Q14324 1141 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 RAD9BQ6WBX8 426 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC9A9Q8IVB4 645 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 RDH13Q8NBN7 331 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASAP3Q8TDY4 903 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 BORCS6Q96GS4 357 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 H0YCG3 227 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 MMP3P08254 477 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 FECHP22830 423 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCD1P33897 745 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBED6P86452 979 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 FIGNQ5HY92 759 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEK11Q8NG66 645 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DNAJC7Q99615 494 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 CBWD1Q9BRT8 395 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 MKNK1Q9BUB5 465 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 EXOC7Q9UPT5 735 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PQJ5 194 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD63C9JTQ0 380 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCP2P22307 547 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLRA2P23416 452 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAMPTP43490 491 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP2R3AQ06190 1150 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP2R5AQ15172 486 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 C12orf56Q8IXR9 622 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC35C1Q96A29 364 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DESI2Q9BSY9 194 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNPEPQ9H4A4 650 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPC6Q9Y210 931 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D8O95759 1140 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP2K2P36507 400 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DGKDQ16760 1214 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP26C1Q6V0L0 522 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMTC1Q8IUR5 882 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP4K3Q8IVH8 894 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHP1Q99653 195 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 A6NJR5 290 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 APBA1Q02410 837 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 SP3Q02447 781 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF484Q5JVG2 852 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 IER5Q5VY09 327 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQCDQ96DY2 449 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPBP1Q9NZL4 362 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 GABRQQ9UN88 632 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 Q9Y3F1 56 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 H3BRB1 525 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF286BP0CG31 522 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNT1P13805 278 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DRP2Q13474 957 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR59Q6PJI9 974 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAS1R3Q7RTX0 852 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TCP11Q8WWU5 503 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRIQ4A6NIV6 560 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOL4O94818 638 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNGA1P29973 690 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 FLT3LGP49771 235 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPN14Q15678 1187 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TLK2Q86UE8 772 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 REXO1L1PQ8IX06 675 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 XXYLT1Q8NBI6 393 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEPTORQ8TB45 409 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL1A2P08123 1366 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCP110O43303 1012 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZSCAN12O43309 604 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM49P0CI25 452 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM49CP0CI26 452 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 INSRRP14616 1297 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADSSP30520 456 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF22Q14807 665 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRAGAQ7L523 313 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPIHBP1Q8IV16 184 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 BICD1Q96G01 975 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRC4Q9NPP4 1024 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF186Q9NXI6 227 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACTN1P12814 892 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC9A1P19634 815 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 VEGFBP49765 207 aa19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms