RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	DNM3	Q9UQ16	869 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TTC3	P53804	2025 aa		11.21	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH11	P35749	1972 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PEX3	P56589	373 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DEFB123	Q8N688	67 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SEPT8	Q92599	483 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DHX58	Q96C10	678 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		11.21	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC169	A6NNP5	214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LAD1	O00515	517 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TLL1	O43897	1013 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNJ6	P48051	423 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DNM2	P50570	870 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GRIN2C	Q14957	1233 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PPM1E	Q8WY54	764 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DENND3	A2RUS2	1198 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC16A4	O15374	487 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DGAT1	O75907	488 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LYPLA2	O95372	231 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ARL2	P36404	184 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MAPK7	Q13164	816 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GPBP1	Q86WP2	473 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RAB34	Q9BZG1	259 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.2	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TISP43	B9A030	160 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	EYA4	O95677	639 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	AFM	P43652	599 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SPATA32	Q96LK8	384 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MYMK	A6NI61	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CYP11B2	P19099	503 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNA1	Q09470	495 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NME8	Q8N427	588 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GJB5	O95377	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ACTN1	P12814	892 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	AKAP5	P24588	427 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RFC5	P40937	340 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	OSTN	P61366	133 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RAD54L	Q92698	747 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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