RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1-218ENST00000556262 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 TRIM49P0CI25 452 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 TRIM49CP0CI26 452 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ACTN1P12814 892 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SLC9A1P19634 815 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CNGA1P29973 690 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 LAMC2Q13753 1193 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 MYBPC2Q14324 1141 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 MEA1Q16626 185 aa20.38■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 BAP1Q92560 729 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 IQCDQ96DY2 449 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ZMYND15Q9H091 742 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.38■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 USP20Q9Y2K6 914 aa20.38■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.38■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 HVCN1Q96D96 273 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 TRPC6Q9Y210 931 aa20.37■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 KIF3CO14782 793 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.37■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SMPD1P17405 629 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 INHBEP58166 350 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 DLG4P78352 724 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 BFSP1Q12934 665 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 MAP2K5Q13163 448 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CRHR2Q13324 411 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SAAL1Q96ER3 474 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.36■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 LGALS2P05162 132 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CCDC175P0C221 793 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PON1P27169 355 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 NAMPTP43490 491 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PPTC7Q8NI37 304 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CCDC102AQ96A19 550 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 GANQ9H2C0 597 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CEP72Q9P209 647 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.35■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 ZNF286BP0CG31 522 aa20.35■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 GCNT4Q9P109 453 aa20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 FMO5P49326 533 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 SLC26A2P50443 739 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PPP2R5AQ15172 486 aa20.34■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.34■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 GBP6Q6ZN66 633 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SDR39U1-218ENST00000556262 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.34■□□□□ 0.85
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SDR39U1-218ENST00000556262 EVPLQ92817 2033 aa20.34■□□□□ 0.85
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