RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550167.5

NTM-222, Transcript of neurotrimin, human

TSL 5

Gene NTM, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NTM-222	ENST00000550167	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	PDILT	Q8N807	584 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	KCNN1	Q92952	543 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	NR1I2	O75469	434 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	AMPD3	Q01432	767 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	MCM6	Q14566	821 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	MTERF2	Q49AM1	385 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	DHX58	Q96C10	678 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	PLIN2	Q99541	437 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	MTR	Q99707	1265 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NTM-222	ENST00000550167	CAND2	O75155	1236 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	KLRC1	P26715	233 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	ZNF131	P52739	623 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	EMC2	Q15006	297 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	NME8	Q8N427	588 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167		A0A087WWV3	80 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	MYMK	A6NI61	221 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TREH	O43280	583 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	ARL2	P36404	184 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	MAPK7	Q13164	816 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	IER5	Q5VY09	327 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	DAW1	Q8N136	415 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	CNNM3	Q8NE01	707 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	CIT	O14578	2027 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	ASAP2	O43150	1006 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	AMH	P03971	560 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TMOD1	P28289	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	THPO	P40225	353 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	EHHADH	Q08426	723 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	GIT2	Q14161	759 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NTM-222	ENST00000550167	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21

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