RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548620.1

USP15-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 816 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-209ENST00000548620 GAREM2Q75VX8 874 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-209ENST00000548620 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
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USP15-209ENST00000548620 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-209ENST00000548620 PIK3C3Q8NEB9 887 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-209ENST00000548620 ATL2Q8NHH9 583 aa7.29□□□□□ -1.24
USP15-209ENST00000548620 RSAD2Q8WXG1 361 aa7.29□□□□□ -1.24
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USP15-209ENST00000548620 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-209ENST00000548620 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.28□□□□□ -1.24
USP15-209ENST00000548620 COG1Q8WTW3 980 aa7.28□□□□□ -1.24
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USP15-209ENST00000548620 PHLDB1Q86UU1 1377 aa7.28□□□□□ -1.24
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USP15-209ENST00000548620 LY86O95711 162 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 UGT8Q16880 541 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 UIMC1Q96RL1 719 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 KLC2Q9H0B6 622 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 DEF6Q9H4E7 631 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.27□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 A0A1W2PRX2 142 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 MTSS1O43312 755 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 COMTP21964 271 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 LGALS4P56470 323 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 FAPQ12884 760 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 FOXL1Q12952 345 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 GRM7Q14831 915 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 Q6ZSN1 163 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 ORAI2Q96SN7 254 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.26□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 A0A1W2PR48 441 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 AMPD3Q01432 767 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 MGAT5Q09328 741 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 IL23AQ9NPF7 189 aa7.25□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 EDARQ9UNE0 448 aa7.25□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 K7ESF4 209 aa7.24□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.24□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.23□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.22□□□□□ -1.25
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USP15-209ENST00000548620 TMEM127O75204 238 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 KCNK18Q7Z418 384 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 PALM2Q8IXS6 379 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 ADOQ96SZ5 270 aa7.22□□□□□ -1.25
USP15-209ENST00000548620 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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