RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-208	ENST00000547298	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-208	ENST00000547298	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DDHD2	O94830	711 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	C1QTNF9	P0C862	333 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MAP4K1	Q92918	833 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZNF302	Q9NR11	478 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	C2CD2L	O14523	706 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	BACH1	O14867	736 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	LRP3	O75074	770 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SOD2	P04179	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RET	P07949	1114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SPATA31D3	P0C874	917 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	GPC3	P51654	580 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MTAP	Q13126	283 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CSRP2	Q16527	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MEIS1	O00470	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZZEF1	O43149	2961 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	GLUD1	P00367	558 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MARCH5	Q9NX47	278 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	AKT3	Q9Y243	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SOBP	A7XYQ1	873 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	NRP1	O14786	923 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ADH1A	P07327	375 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	KCNA4	P22459	653 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SMARCA1	P28370	1054 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	AK2	P54819	239 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CEP55	Q53EZ4	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	LILRA6	Q6PI73	481 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MYL10	Q9BUA6	226 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	IL25	Q9H293	177 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	STK39	Q9UEW8	545 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MAGEB2	O15479	319 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	TGM5	O43548	720 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZNF623	O75123	536 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	NTHL1	P78549	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	DRP2	Q13474	957 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RILPL2	Q969X0	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	PIDD1	Q9HB75	910 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	LY9	Q9HBG7	655 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CS-208	ENST00000547298	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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