RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM150B	A6NC51	233 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557		F8W810	466 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	C2CD2L	O14523	706 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SGSM2	O43147	1006 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	STBD1	O95210	358 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	EFEMP2	O95967	443 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF76	P36508	570 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CLUH	O75153	1309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WZ62	844 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	INPPL1	O15357	1258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TEX28	O15482	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CYP3A4	P08684	503 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	LAMP2	P13473	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	LIFR	P42702	1097 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ADCY7	P51828	1080 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GPC5	P78333	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	HTR4	Q13639	388 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	KSR1	Q8IVT5	923 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GJA10	Q969M2	543 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	LENG9	Q96B70	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NRP1	O14786	923 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF623	O75123	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PAPLN	O95428	1278 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	OAT	P04181	439 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PSAP	P07602	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	STARD6	P59095	220 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RFX1	P22670	979 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TMOD1	P28289	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MCM5	P33992	734 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	AK2	P54819	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCE	Q02156	737 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	FGF14	Q92915	247 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-222	ENST00000533557	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	POMC	P01189	267 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	SOD2	P04179	222 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	ALDH2	P05091	517 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-222	ENST00000533557	CALM1	P0DP23	149 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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