RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.65■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 TRAK2O60296 914 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 EFCAB14O75071 495 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 ACTN1P12814 892 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 POSTNQ15063 836 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 UNC13DQ70J99 1090 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 PANK4Q9NVE7 773 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 DACT1Q9NYF0 836 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.64■□□□□ 0.9
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC169A6NNP5 214 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ERLIN2O94905 339 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MCM4P33991 863 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 NCKAP1LP55160 1127 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ALCAMQ13740 583 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 BAIAP3O94812 1187 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MAPK6Q16659 721 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FAM187BQ17R55 369 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FAM228AQ86W67 206 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 HVCN1Q96D96 273 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM134Q9H6X4 195 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 PADI3Q9ULW8 664 aa20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 SFI1A8K8P3 1242 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 H0YGN5 161 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 AXLP30530 894 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CUL4BQ13620 913 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 GPNMBQ14956 572 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.62■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 K7ENM7 598 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CD52P31358 61 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 DPYDQ12882 1025 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 COASYQ13057 564 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 SFR1Q86XK3 245 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CHST12Q9NRB3 414 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 K7ERI5 159 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 SMC2O95347 1197 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FZD8Q9H461 694 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 EXOC1Q9NV70 894 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 RMND1Q9NWS8 449 aa20.61■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 SLC16A4O15374 487 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 STRN3Q13033 797 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 PSMD2Q13200 908 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 IKBKEQ14164 716 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC51Q96ER9 411 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 GDF15Q99988 308 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 POLD4Q9HCU8 107 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.6■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 DENND3A2RUS2 1198 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FGBP02675 491 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 PRKCBP05771 671 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 EHHADHQ08426 723 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 KCNB1Q14721 858 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 GSDMAQ96QA5 445 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 FIZ1Q96SL8 496 aa20.59■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 ACKR2O00590 384 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 BMP8BP34820 402 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 GTF2BQ00403 316 aa20.58■□□□□ 0.89
PTPRK-218ENST00000525459 KIFC3Q9BVG8 833 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms