RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 PPARAQ07869 468 aa5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 RASSF3Q86WH2 238 aa5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 SOX7Q9BT81 388 aa5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 MSL2Q9HCI7 577 aa5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 TLR9Q9NR96 1032 aa5.97□□□□□ -1.45
CPEB4-210ENST00000522344 CAPN14A8MX76 684 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ULK1O75385 1050 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 LPLP06858 475 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PFKMP08237 780 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 KIR2DL3P43628 341 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CD69Q07108 199 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 NRN1LQ496H8 165 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CT83Q5H943 113 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 Q6ZSN1 163 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EDAQ92838 391 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ARL8AQ96BM9 186 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TCF25Q9BQ70 676 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 OSBPL6Q9BZF3 934 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 IL23AQ9NPF7 189 aa5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 MATN3O15232 486 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 JUNP05412 331 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 GAAP10253 952 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 SESN3P58005 492 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ADAM8P78325 824 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TMPRSS15P98073 1019 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 MGAT5Q09328 741 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 GAGE13Q4V321 117 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ING3Q9NXR8 418 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.95□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 NRP2O60462 931 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 BRINP1O60477 761 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 AMHP03971 560 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CPEP16870 476 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 NRG3P56975 720 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PDCD1Q15116 288 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EXTL1Q92935 676 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EPC1Q9H2F5 836 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PRSS50Q9UI38 385 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EDARQ9UNE0 448 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.94□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ALDH1A2O94788 518 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 LY86O95711 162 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TNFRSF1AP19438 455 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 NPEPPSP55786 919 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 LGALS4P56470 323 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CRHR2Q13324 411 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 STAT4Q14765 748 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 UGT8Q16880 541 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 OR14C36Q8NHC7 312 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 VPS11Q9H270 941 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.93□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 GOLGA8AA7E2F4 631 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 GPR15P49685 360 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 FKBP15Q5T1M5 1219 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 GLB1L2Q8IW92 636 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CMIPQ8IY22 773 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 OR5M3Q8NGP4 307 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ATL2Q8NHH9 583 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CSRNP2Q9H175 543 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.92□□□□□ -1.46
CPEB4-210ENST00000522344 CYP27B1O15528 508 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms