RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HAPLN2Q9GZV7 340 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GINM1Q9NU53 330 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FOXJ2Q9P0K8 574 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NCDNQ9UBB6 729 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DIRC3C9JPN6 131 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FDXRP22570 491 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ITPKBP27987 946 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRTAP10-12P60413 245 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCNA1Q09470 495 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR19Q15760 415 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ETFDHQ16134 617 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q6ZTC4 211 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KRT78Q8N1N4 520 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCAF4Q8WV16 495 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDLIM2Q96JY6 352 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IPPKQ9H8X2 491 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FLRT1Q9NZU1 646 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARCH11A6NNE9 402 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRKCGP05129 697 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMEP08473 750 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR85P60893 370 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM214AQ32MH5 1076 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF626Q68DY1 528 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARMC6Q6NXE6 501 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q6ZNX1 250 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EP400NLQ6ZTU2 488 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASB6Q9NWX5 421 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF181Q9P0P0 153 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MDFICQ9P1T7 246 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOTCH4Q99466 2003 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LEFTY2O00292 366 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MTSS1O43312 755 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC24A1O60721 1099 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FHL3Q13643 280 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BMT2Q1RMZ1 405 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF628Q5EBL2 1059 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC9A4Q6AI14 798 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KCNT2Q6UVM3 1135 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM83AQ86UY5 434 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IFNL3Q8IZI9 196 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VGLL2Q8N8G2 317 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASB15Q8WXK1 588 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SHDQ96IW2 340 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA32Q96LK8 384 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UROC1Q96N76 676 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALG1Q9BT22 464 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BTBD3Q9Y2F9 522 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ASB1Q9Y576 335 aa2.22□□□□□ -2.05
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 DLX3O60479 287 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DNAJC6O75061 913 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AMY2AP04746 511 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA31D3P0C874 917 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRR35P0CG20 571 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AMY2BP19961 511 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRIA2P42262 883 aa2.21□□□□□ -2.06
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RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MXRA7P84157 204 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCAPQ12770 1279 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AKNAD1Q5T1N1 836 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DOK3Q7L591 496 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HIPK4Q8NE63 616 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR5AN1Q8NGI8 311 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACTRT2Q8TDY3 377 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SARAFQ96BY9 339 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 Q96MF0 132 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HEPHQ9BQS7 1158 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TEX101Q9BY14 249 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WNT9AO14904 365 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FOSP01100 380 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIR2DL3P43628 341 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NHLH2Q02577 135 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RESTQ13127 1097 aa2.2□□□□□ -2.06
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DGKDQ16760 1214 aa2.2□□□□□ -2.06
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