RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.57■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 RNF149Q8NC42 400 aa21.57■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PIGOQ8TEQ8 1089 aa21.57■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.57■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TLE6Q9H808 572 aa21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ANKEF1Q9NU02 776 aa21.56■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PER2O15055 1255 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ASAP2O43150 1006 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 OR52Z1P0C646 297 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 SKIP12755 728 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TECP42680 631 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 RARRES1P49788 294 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 RAB27AP51159 221 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PLCB3Q01970 1234 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 RABEP1Q15276 862 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TTC38Q5R3I4 469 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 EFHBQ8N7U6 833 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 FAM50BQ9Y247 325 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa21.55■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 FSCN2O14926 492 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 DGAT1O75907 488 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PPM1AP35813 382 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 NBR1Q14596 966 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 GJD3Q8N144 294 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 SPG21Q9NZD8 308 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 CD207Q9UJ71 328 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 LZTS1Q9Y250 596 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.54■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MBTPS2O43462 519 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MED24O75448 989 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ERLIN2O94905 339 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 GLP2RO95838 553 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 BCAR1P56945 870 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 KRT17Q04695 432 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TCF25Q9BQ70 676 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 CLEC1BQ9P126 229 aa21.53■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ST18O60284 1047 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF623O75123 536 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PTENP60484 403 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 CAPSQ13938 189 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TFDP1Q14186 410 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 UBXN11Q5T124 520 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 PGBD4Q96DM1 585 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTBP1-211ENST00000511907 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 OFD1O75665 1012 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 ARL2P36404 184 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 DUSP6Q16828 381 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 POTEGQ6S5H5 508 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 TMC7Q7Z402 723 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 CPB2Q96IY4 423 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 GBP3Q9H0R5 595 aa21.51■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 HIDE1A8MVS5 230 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 TSPAN1O60635 241 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 GLRA2P23416 452 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 ZP2Q05996 745 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 ERMNQ8TAM6 284 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.5■■□□□ 1.03
CTBP1-211ENST00000511907 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms