RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511207.5

CCNH-209, Transcript of cyclin H, human

TSL 2

Gene CCNH, Length 451 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-209	ENST00000511207	CELA3B	P08861	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	NCAM1	P13591	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SDHB	P21912	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	FBLN1	P23142	703 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	EDNRB	P24530	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GALK1	P51570	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	CACNB3	P54284	484 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	CDK17	Q00537	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	MGAT2	Q10469	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GJA10	Q969M2	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	PTPN18	Q99952	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207		A6NNZ2	444 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	PMM2	O15305	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	PDE6B	P35913	854 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	STAT5A	P42229	794 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	NEK3	P51956	506 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	AK2	P54819	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	DGKD	Q16760	1214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GOLIM4	O00461	696 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SGTA	O43765	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	C8A	P07357	584 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GLI1	P08151	1106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SLC5A1	P13866	664 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	IL13RA1	P78552	427 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCNH-209	ENST00000511207		A0A088AWK7	358 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207		A0A1W2PR48	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	FRS3	O43559	492 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	CREB3	O43889	395 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	PEX10	O60683	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	PHF2	O75151	1096 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	CYP7B1	O75881	506 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	IL18BP	O95998	194 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	ALDH2	P05091	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	C8B	P07358	591 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	CYP2C8	P10632	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	HTR1B	P28222	390 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	VIPR1	P32241	457 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCNH-209	ENST00000511207	TM4SF4	P48230	202 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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