RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 OLFML3Q9NRN5 406 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 EXOC1Q9NV70 894 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 SQORQ9Y6N5 450 aa23.34■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 SMC2O95347 1197 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 LPIN1Q14693 890 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 GPNMBQ14956 572 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 MFSD5Q6N075 450 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 SMARCE1Q969G3 411 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.33■■□□□ 1.33
TTYH3-207ENST00000498454 TET1Q8NFU7 2136 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 K7ENM7 598 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 NBNO60934 754 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 KCNB1Q14721 858 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 FAM228AQ86W67 206 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 USP38Q8NB14 1042 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SPATA20Q8TB22 786 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 HPS3Q969F9 1004 aa23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 H0YCG3 227 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 RPS6KA5O75582 802 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 RHOBTB3O94955 611 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 FGFR4P22455 802 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 RFC2P35250 354 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 EFNA5P52803 228 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM199Q8N511 208 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 GSDMAQ96QA5 445 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.31■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 DENND3A2RUS2 1198 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CD52P31358 61 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 BADQ92934 168 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 KCNN1Q92952 543 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ERVK-5Q9HDB9 667 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 RMND1Q9NWS8 449 aa23.3■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 K7ERI5 159 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 GCNT3O95395 438 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CXCL10P02778 98 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PRKCBP05771 671 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CSF2RAP15509 400 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PAK2Q13177 524 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PSMD2Q13200 908 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 MAPK6Q16659 721 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 GLIS3Q8NEA6 775 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 FZD8Q9H461 694 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PADI3Q9ULW8 664 aa23.29■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 GPR182O15218 404 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PPP1R37O75864 691 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 MYBP10242 640 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SCP2P22307 547 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 CASP5P51878 434 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 GTF2BQ00403 316 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ALCAMQ13740 583 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 AMHR2Q16671 573 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 FAM187BQ17R55 369 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 STRA6Q9BX79 667 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.28■■□□□ 1.32
TTYH3-207ENST00000498454 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms