RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	INTS13	Q9NVM9	706 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KAT6A	Q92794	2004 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC169	A6NNP5	214 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MSC	O60682	206 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MMP3	P08254	477 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CNGA1	P29973	690 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AP3M2	P53677	418 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	GJA9	P57773	515 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBED6	P86452	979 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SP4	Q02446	784 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM187B	Q17R55	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	NME8	Q8N427	588 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TMC2	Q8TDI7	906 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	AFG1L	Q8WV93	481 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	BORCS6	Q96GS4	357 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	TRPC6	Q9Y210	931 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.28	□□□□□ -0.76
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC16A4	O15374	487 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SEPT4	O43236	478 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TEX33	O43247	280 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	EXOC3	O60645	756 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	F2	P00734	622 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CAPN2	P17655	700 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PTGS1	P23219	599 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GLRA2	P23416	452 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ANXA13	P27216	316 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GRM1	Q13255	1194 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MAP7D2	Q96T17	732 aa		10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	HAS3	O00219	553 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ACKR2	O00590	384 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MFAP3L	O75121	409 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CABYR	O75952	493 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	AKAP3	O75969	853 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	SKIL	P12757	684 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	INSRR	P14616	1297 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP2B6	P20813	491 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PHKA2	P46019	1235 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PTEN	P60484	403 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	BFSP1	Q12934	665 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MAPK6	Q16659	721 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TLK2	Q86UE8	772 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TC2N	Q8N9U0	490 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	NEK11	Q8NG66	645 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	COPS5	Q92905	334 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	DNAJC7	Q99615	494 aa		10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
LPIN3-204	ENST00000496565	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms