RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.32■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 EML1O00423 815 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CPLX1O14810 134 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 SLC37A4O43826 429 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CTSAP10619 480 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 RAB27AP51159 221 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.31■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 KSR1Q8IVT5 923 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 IGSF21Q96ID5 467 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 VAV3Q9UKW4 847 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.31■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 OFD1O75665 1012 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 GALTP07902 379 aa22.3■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 PPP2R5CQ13362 524 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 GIT2Q14161 759 aa22.3■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB33Q86T24 672 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.3■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.3■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 AVPR2P30518 371 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CA8P35219 290 aa22.29■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 LONRF3Q496Y0 759 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 PPME1Q9Y570 386 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.29■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 B4GALT3O60512 393 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 EPCAMP16422 314 aa22.28■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 STK3Q13188 491 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 LETM2Q2VYF4 491 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 C8orf34Q49A92 452 aa22.28■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 FAM20AQ96MK3 541 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.28■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.28■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 SLC11A1P49279 550 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 MTMR3Q13615 1198 aa22.27■■□□□ 1.16
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NELFE-212ENST00000492539 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.27■■□□□ 1.16
NELFE-212ENST00000492539 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.27■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 BRD1O95696 1058 aa22.26■■□□□ 1.15
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NELFE-212ENST00000492539 WEE2P0C1S8 567 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PTPN14Q15678 1187 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.26■■□□□ 1.15
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NELFE-212ENST00000492539 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CEP170P1Q96L14 293 aa22.26■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TBX3O15119 743 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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NELFE-212ENST00000492539 NUBP1P53384 320 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SCRN1Q12765 414 aa22.25■■□□□ 1.15
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