RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 NHSQ6T4R5 1651 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 STRCQ7RTU9 1775 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 RASGRF2O14827 1237 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZBTB5O15062 677 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TGFB1I1O43294 461 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 RAD21O60216 631 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PHF2O75151 1096 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 LRRN2O75325 713 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 COG2Q14746 738 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 LONRF1Q17RB8 773 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF804AQ7Z570 1209 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 FAM186BQ8IYM0 893 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SLC20A1Q8WUM9 679 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 DYDC1Q8WWB3 177 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF570Q96NI8 536 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SYT11Q9BT88 431 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ANO3Q9BYT9 981 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 USP40Q9NVE5 1235 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 STK38LQ9Y2H1 464 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ALG6Q9Y672 507 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 DIAPH2O60879 1101 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 KRT16P08779 473 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM49P0CI25 452 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TRIM49CP0CI26 452 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SLURP2P0DP57 97 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 RPL13P26373 211 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 LLGL1Q15334 1064 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CBWD6Q4V339 395 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 BORCS6Q96GS4 357 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 STK33Q9BYT3 514 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 NYXQ9GZU5 481 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.05□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SBF2Q86WG5 1849 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TNFAIP3P21580 790 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 KCNJ1P48048 391 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PDE6CP51160 858 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SLC8A3P57103 927 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PPP2R5EQ16537 467 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 FMO5P49326 533 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 GALNTL6Q49A17 601 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ERICH1Q86X53 443 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 GDAP1Q8TB36 358 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 MXD3Q9BW11 206 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.04□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 PFASO15067 1338 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM120BA0PK00 339 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ACSL3O95573 720 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TTLL1O95922 423 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CHRNA3P32297 505 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CYP2J2P51589 502 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 SNAP25P60880 206 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 RNF217Q8TC41 542 aa11.03□□□□□ -0.64
VWA3B-217ENST00000489630 KLHL29Q96CT2 875 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms